本やゲームを電子書籍、ダウンロード販売する際に紙媒体、パッケージ販売と販売価格に差は出るんですか？

メーカーによってそれぞれ異なります。

紙媒体と同じ価格設定の出版社もあれば1～2割安い価格設定のところもあります。
ゲームも同様にほぼ定価の任天堂、1、2割安いsonyとメーカーによって様々です。