東方緋想天の進行データを初期化するには どうしたらいいのでしょうか？

該当データを直接削除して下さい。

メインの進行データはscore.dat。
プロファイルやリプレイはそれぞれのProfileフォルダ内のdatファイルとReplayフォルダ内のrepファイル。
オプション等設定はconfig.dat。