長く放送しているアニメ（ナルトやワンピース）にはアンチが多いですがポケモンや遊戯王（ゼアルを除く）

『ONE PIECE』や『NARUTO』と比べれば両作とも視聴者に偏りがあるからだと思います。
熱心に追いかけるファンもいるでしょうが、一般的には小中学生が最も多く視聴しているのではないでしょうか?
『ONE PIECE』・『NARUTO』は日本国外でも注目されており、日本人でタイトルすら知らない人はいないでしょう。
そういった意味では『遊☆戯☆王』・『ポケットモンスター』も同じですが、こちらは4年前後で新シリーズに移行するスタンスなので、シリーズ毎の批判や不満点はよく耳にします。
世界観を一新して、登場人物の年齢層を下げた『遊☆戯☆王ZEXAL』。
原点回帰の一環として、主人公サトシの極端な弱体化や人気キャラクターだったタケシの離脱等が挙げられる『ポケットモンスターベストウイッシュ』。
等を中心に○○シリーズは認めるが△△は認めない等のコメントはよく目にします。

遊戯王は知らないけどポケモンは万人受けする内容なんじゃないですか。
わざわざ文句見つけて言うようなことがないというか。