幻塔の限定ガチャの天井は、次の限定のキャラが来ても引き継がれるんですか？

引いた回数はそのまま引き継がれるとの事です。
ただしコインは恒常コインに変換されるので交換する場合は限定が終わる前にやっておくと良いかと。