Switchの設定でフレンドに自分がオンラインしているのを見せない設定にしているとスプラトゥーン3

遊んでいる時点で遊んでいることはバレません。

プレイ記録の公開の設定はどうなっていますか？
こちらも非公開になっているのであればバレません。公開されていれば、いつ遊んだかはバレませんが、スプラを遊んだということはバレる可能性があります。