プリコネ クラバトでオートを入れたり切ったりするのは何か意味があるのでしょうか？

それなら全部手動でやった方が早いのではないでしょうか？

オートを入れるのは、タイミングの正確性が欲しいとき。
オフにするのは発動順に問題が起こる時、
または意図的に早めたい、遅らせたい場合があるため。