プリコネについて質問です。最近ガチャを引いて女神の秘石が1600ほどあるんですがこの中で専用装備

下の方のプリコロ星5というのは賛成ですね、
ただ初心者さんの場合、ダメージソースであるムイミの火力を伸ばしたいなとも思いますので、個人的には

ムイミ専用(最優先)→ムイミ星5あるいはプリコロ星5→そのあとはラビリスタかニャルまたはネネカあたりの星5ですかね

基本的に専用装備のあるキャラは、専用装備⇒星上げです。
状況次第、レベル・ランク次第、という点はありますが、基本的には専用装備による強化は星上げ以上の価値を持ちます。
その上で、他の方が書いているように現状ならばプリコロを5にして調整できるようにしておくと、魔法編成などでは前衛として活躍させることもできるようになります。

星上げはプリフェスキャラではムイミ・ラビリスタ等の火力を担うこともあるキャラを上げていいですし、星4と中途半端なネネカも上げてよいかもしれません。
ランクを上げるならできれば一気に5、無理なら3のままでよいです。
この中以外ですと、ハードで星上げの機会は多いもののやや時間がかかる、レイ等を上げてもよいかもしれません。
VHでピュアピース集め終えてからでも十分かもしれませんが。