FGOの６章で、アグラヴェインはランスロットに勝ったんですか？ 文官でしたよね…

アグラヴェインが勝ってます。
その戦いの負傷で亡くなりましたが。
ゲームでも映画でもランスロットを討ちとった絵はないけど、ゲームで討った事を獅子王に報告してます。

文官ですけど、強化兵の実験を行なって自分も強化してましたし、何よりアグラヴェインの執念、今度こそアーサー王に千年王国を献上するのだって意志が、実力差を凌駕していたって事かと思います。

アグラヴェインは円卓の騎士ですから、本来は「文官」じゃなくて「騎士」です。だから戦っても強いです。
ただ、実務能力も高いので事実上文官の最高責任者の様な事もしていました。