龍が如く1～4をプレイし終わり5をプレイ中なのですが、人間関係や組織関係が複雑で覚えきれていません

東城会←関東最大勢力の極道組織。
桐生たちやその他ストーリーに大きく絡む極道たちが所属しています。

近江連合→関西の極道組織。
2の龍司や、5なら勝矢、渡瀬が所属しています。

桐生さんの現役時代の肩書きの舎弟頭補佐についてですが、

一般的に組のトップは組長。
（組織によって総長、会長などいいますがここでは組長で）
その次に偉い人が若頭。
若頭は時期組長候補。

その下に若衆がいます。
若衆は平社員といったところでしょうか。

そして組長の兄弟分が舎弟にあたります。
舎弟たちをまとめるリーダーが舎弟頭。
なので桐生は舎弟頭の補佐の役目です。

通常、舎弟というのは組の裏方サポートです。
時期組長は若頭で、舎弟たちは組長になるコースではないです。

錦が「舎弟頭補佐なんて煙たがられる立場でもないけど、出世の本筋でもねぇ微妙な立場じゃねぇか」と言っていたのはそのためです。