龍が如く ジャッジアイズ ロストジャッジメントの歴代の「亜門」はどのシリーズが強いですか？

PS2版の龍が如く 初代だと思います。

とりあえず全タイトルで撃破していますが、PS2版初代の亜門はシステムや難易度を無視した作り+戦闘システムに粗が多く操作性が悪い、でPS2版の2以降よりもあからさまに壊れていて、真の隠しボスと言っても過言ではない内容です。
(現行でプレイするには、PS3で初代リマスターをプレイするしかありません。PS Nowにあるかは分かりません。)

2以降の亜門は調整がされていますし、戦闘システムも改善されたので戦いやすくなっていますので、初代の亜門と比べれば【頑張れば倒せる亜門】になっています。

初代の亜門は【頑張りを粉砕する亜門】です。